Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms