Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ18

Rnaseh2c, Ribonuclease H2 subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnaseh2cQ9CQ18 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnaseh2cQ9CQ18 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnaseh2cQ9CQ18 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnaseh2cQ9CQ18 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnaseh2cQ9CQ18 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnaseh2cQ9CQ18 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnaseh2cQ9CQ18 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnaseh2cQ9CQ18 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnaseh2cQ9CQ18 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnaseh2cQ9CQ18 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnaseh2cQ9CQ18 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnaseh2cQ9CQ18 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnaseh2cQ9CQ18 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnaseh2cQ9CQ18 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnaseh2cQ9CQ18 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnaseh2cQ9CQ18 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnaseh2cQ9CQ18 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnaseh2cQ9CQ18 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnaseh2cQ9CQ18 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnaseh2cQ9CQ18 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnaseh2cQ9CQ18 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnaseh2cQ9CQ18 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnaseh2cQ9CQ18 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnaseh2cQ9CQ18 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnaseh2cQ9CQ18 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnaseh2cQ9CQ18 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnaseh2cQ9CQ18 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnaseh2cQ9CQ18 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnaseh2cQ9CQ18 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnaseh2cQ9CQ18 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnaseh2cQ9CQ18 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnaseh2cQ9CQ18 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnaseh2cQ9CQ18 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnaseh2cQ9CQ18 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnaseh2cQ9CQ18 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnaseh2cQ9CQ18 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnaseh2cQ9CQ18 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnaseh2cQ9CQ18 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnaseh2cQ9CQ18 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnaseh2cQ9CQ18 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnaseh2cQ9CQ18 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnaseh2cQ9CQ18 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnaseh2cQ9CQ18 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnaseh2cQ9CQ18 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnaseh2cQ9CQ18 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnaseh2cQ9CQ18 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnaseh2cQ9CQ18 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnaseh2cQ9CQ18 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnaseh2cQ9CQ18 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnaseh2cQ9CQ18 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnaseh2cQ9CQ18 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnaseh2cQ9CQ18 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnaseh2cQ9CQ18 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnaseh2cQ9CQ18 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnaseh2cQ9CQ18 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnaseh2cQ9CQ18 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnaseh2cQ9CQ18 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnaseh2cQ9CQ18 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnaseh2cQ9CQ18 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnaseh2cQ9CQ18 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnaseh2cQ9CQ18 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnaseh2cQ9CQ18 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnaseh2cQ9CQ18 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnaseh2cQ9CQ18 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnaseh2cQ9CQ18 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnaseh2cQ9CQ18 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnaseh2cQ9CQ18 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rnaseh2cQ9CQ18 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rnaseh2cQ9CQ18 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Rnaseh2cQ9CQ18 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms