Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV0

Prpf8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf8Q99PV0 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Prpf8Q99PV0 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Prpf8Q99PV0 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Prpf8Q99PV0 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Prpf8Q99PV0 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Prpf8Q99PV0 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Prpf8Q99PV0 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Prpf8Q99PV0 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Prpf8Q99PV0 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Prpf8Q99PV0 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Prpf8Q99PV0 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Prpf8Q99PV0 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Prpf8Q99PV0 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Prpf8Q99PV0 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Prpf8Q99PV0 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Prpf8Q99PV0 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Prpf8Q99PV0 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prpf8Q99PV0 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prpf8Q99PV0 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prpf8Q99PV0 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prpf8Q99PV0 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prpf8Q99PV0 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prpf8Q99PV0 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Prpf8Q99PV0 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prpf8Q99PV0 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prpf8Q99PV0 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prpf8Q99PV0 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prpf8Q99PV0 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prpf8Q99PV0 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prpf8Q99PV0 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prpf8Q99PV0 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prpf8Q99PV0 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prpf8Q99PV0 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prpf8Q99PV0 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prpf8Q99PV0 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Prpf8Q99PV0 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Prpf8Q99PV0 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prpf8Q99PV0 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prpf8Q99PV0 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prpf8Q99PV0 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prpf8Q99PV0 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prpf8Q99PV0 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prpf8Q99PV0 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prpf8Q99PV0 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prpf8Q99PV0 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prpf8Q99PV0 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prpf8Q99PV0 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prpf8Q99PV0 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prpf8Q99PV0 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prpf8Q99PV0 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Prpf8Q99PV0 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prpf8Q99PV0 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prpf8Q99PV0 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prpf8Q99PV0 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prpf8Q99PV0 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prpf8Q99PV0 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prpf8Q99PV0 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prpf8Q99PV0 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prpf8Q99PV0 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Prpf8Q99PV0 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prpf8Q99PV0 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prpf8Q99PV0 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prpf8Q99PV0 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prpf8Q99PV0 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prpf8Q99PV0 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prpf8Q99PV0 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prpf8Q99PV0 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prpf8Q99PV0 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prpf8Q99PV0 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prpf8Q99PV0 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prpf8Q99PV0 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Prpf8Q99PV0 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prpf8Q99PV0 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prpf8Q99PV0 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prpf8Q99PV0 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prpf8Q99PV0 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prpf8Q99PV0 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prpf8Q99PV0 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prpf8Q99PV0 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prpf8Q99PV0 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Prpf8Q99PV0 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Prpf8Q99PV0 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prpf8Q99PV0 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prpf8Q99PV0 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prpf8Q99PV0 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prpf8Q99PV0 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prpf8Q99PV0 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Prpf8Q99PV0 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Prpf8Q99PV0 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Prpf8Q99PV0 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Prpf8Q99PV0 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Prpf8Q99PV0 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Prpf8Q99PV0 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Prpf8Q99PV0 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Prpf8Q99PV0 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Prpf8Q99PV0 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Prpf8Q99PV0 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Prpf8Q99PV0 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Prpf8Q99PV0 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Prpf8Q99PV0 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms