Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms