Protein–RNA interactions for Protein: Q99KW3

Triobp, TRIO and F-actin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TriobpQ99KW3 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms