Protein–RNA interactions for Protein: Q923A2

Spdl1, Protein Spindly, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spdl1Q923A2 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spdl1Q923A2 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spdl1Q923A2 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spdl1Q923A2 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spdl1Q923A2 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spdl1Q923A2 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spdl1Q923A2 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spdl1Q923A2 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Spdl1Q923A2 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spdl1Q923A2 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spdl1Q923A2 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spdl1Q923A2 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spdl1Q923A2 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spdl1Q923A2 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spdl1Q923A2 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spdl1Q923A2 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spdl1Q923A2 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spdl1Q923A2 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spdl1Q923A2 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spdl1Q923A2 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spdl1Q923A2 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spdl1Q923A2 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spdl1Q923A2 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spdl1Q923A2 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spdl1Q923A2 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spdl1Q923A2 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spdl1Q923A2 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spdl1Q923A2 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spdl1Q923A2 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Spdl1Q923A2 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Spdl1Q923A2 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spdl1Q923A2 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spdl1Q923A2 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spdl1Q923A2 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spdl1Q923A2 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spdl1Q923A2 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spdl1Q923A2 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spdl1Q923A2 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Spdl1Q923A2 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spdl1Q923A2 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spdl1Q923A2 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spdl1Q923A2 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spdl1Q923A2 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spdl1Q923A2 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spdl1Q923A2 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spdl1Q923A2 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spdl1Q923A2 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spdl1Q923A2 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spdl1Q923A2 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spdl1Q923A2 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spdl1Q923A2 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spdl1Q923A2 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spdl1Q923A2 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spdl1Q923A2 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spdl1Q923A2 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spdl1Q923A2 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spdl1Q923A2 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spdl1Q923A2 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spdl1Q923A2 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spdl1Q923A2 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spdl1Q923A2 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spdl1Q923A2 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spdl1Q923A2 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spdl1Q923A2 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spdl1Q923A2 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spdl1Q923A2 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spdl1Q923A2 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spdl1Q923A2 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spdl1Q923A2 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spdl1Q923A2 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spdl1Q923A2 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spdl1Q923A2 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spdl1Q923A2 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Spdl1Q923A2 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Spdl1Q923A2 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spdl1Q923A2 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spdl1Q923A2 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spdl1Q923A2 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spdl1Q923A2 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spdl1Q923A2 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spdl1Q923A2 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Spdl1Q923A2 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Spdl1Q923A2 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms