Protein–RNA interactions for Protein: Q91W50

Csde1, Cold shock domain-containing protein E1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csde1Q91W50 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.6 ms