Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms