Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCD6

Reep2, Receptor expression-enhancing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep2Q8VCD6 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Reep2Q8VCD6 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Reep2Q8VCD6 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Reep2Q8VCD6 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Reep2Q8VCD6 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Reep2Q8VCD6 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Reep2Q8VCD6 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Reep2Q8VCD6 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Reep2Q8VCD6 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Reep2Q8VCD6 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Reep2Q8VCD6 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Reep2Q8VCD6 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Reep2Q8VCD6 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Reep2Q8VCD6 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Reep2Q8VCD6 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Reep2Q8VCD6 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Reep2Q8VCD6 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Reep2Q8VCD6 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Reep2Q8VCD6 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Reep2Q8VCD6 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Reep2Q8VCD6 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Reep2Q8VCD6 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Reep2Q8VCD6 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Reep2Q8VCD6 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Reep2Q8VCD6 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Reep2Q8VCD6 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Reep2Q8VCD6 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Reep2Q8VCD6 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Reep2Q8VCD6 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Reep2Q8VCD6 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Reep2Q8VCD6 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Reep2Q8VCD6 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Reep2Q8VCD6 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Reep2Q8VCD6 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Reep2Q8VCD6 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Reep2Q8VCD6 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Reep2Q8VCD6 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Reep2Q8VCD6 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Reep2Q8VCD6 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Reep2Q8VCD6 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Reep2Q8VCD6 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Reep2Q8VCD6 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Reep2Q8VCD6 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Reep2Q8VCD6 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Reep2Q8VCD6 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Reep2Q8VCD6 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Reep2Q8VCD6 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Reep2Q8VCD6 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Reep2Q8VCD6 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Reep2Q8VCD6 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Reep2Q8VCD6 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Reep2Q8VCD6 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Reep2Q8VCD6 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Reep2Q8VCD6 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Reep2Q8VCD6 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Reep2Q8VCD6 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Reep2Q8VCD6 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Reep2Q8VCD6 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Reep2Q8VCD6 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Reep2Q8VCD6 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Reep2Q8VCD6 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Reep2Q8VCD6 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Reep2Q8VCD6 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Reep2Q8VCD6 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Reep2Q8VCD6 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Reep2Q8VCD6 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Reep2Q8VCD6 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Reep2Q8VCD6 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Reep2Q8VCD6 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Reep2Q8VCD6 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Reep2Q8VCD6 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Reep2Q8VCD6 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Reep2Q8VCD6 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Reep2Q8VCD6 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Reep2Q8VCD6 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Reep2Q8VCD6 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Reep2Q8VCD6 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Reep2Q8VCD6 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Reep2Q8VCD6 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Reep2Q8VCD6 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Reep2Q8VCD6 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Reep2Q8VCD6 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Reep2Q8VCD6 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Reep2Q8VCD6 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Reep2Q8VCD6 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Reep2Q8VCD6 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Reep2Q8VCD6 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Reep2Q8VCD6 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Reep2Q8VCD6 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms