Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms