Protein–RNA interactions for Protein: Q8R322

Gle1, Nucleoporin GLE1, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gle1Q8R322 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gle1Q8R322 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gle1Q8R322 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gle1Q8R322 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gle1Q8R322 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gle1Q8R322 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gle1Q8R322 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gle1Q8R322 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gle1Q8R322 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gle1Q8R322 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gle1Q8R322 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gle1Q8R322 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gle1Q8R322 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gle1Q8R322 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gle1Q8R322 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gle1Q8R322 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gle1Q8R322 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gle1Q8R322 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gle1Q8R322 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gle1Q8R322 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gle1Q8R322 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gle1Q8R322 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gle1Q8R322 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gle1Q8R322 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gle1Q8R322 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gle1Q8R322 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gle1Q8R322 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gle1Q8R322 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gle1Q8R322 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gle1Q8R322 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gle1Q8R322 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gle1Q8R322 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gle1Q8R322 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gle1Q8R322 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gle1Q8R322 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gle1Q8R322 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gle1Q8R322 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gle1Q8R322 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gle1Q8R322 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gle1Q8R322 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gle1Q8R322 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gle1Q8R322 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gle1Q8R322 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gle1Q8R322 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gle1Q8R322 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gle1Q8R322 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gle1Q8R322 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gle1Q8R322 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gle1Q8R322 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gle1Q8R322 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gle1Q8R322 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gle1Q8R322 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gle1Q8R322 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gle1Q8R322 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gle1Q8R322 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gle1Q8R322 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gle1Q8R322 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gle1Q8R322 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gle1Q8R322 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gle1Q8R322 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gle1Q8R322 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gle1Q8R322 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gle1Q8R322 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gle1Q8R322 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gle1Q8R322 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gle1Q8R322 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gle1Q8R322 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gle1Q8R322 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gle1Q8R322 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gle1Q8R322 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gle1Q8R322 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gle1Q8R322 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gle1Q8R322 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gle1Q8R322 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gle1Q8R322 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gle1Q8R322 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gle1Q8R322 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gle1Q8R322 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gle1Q8R322 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gle1Q8R322 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gle1Q8R322 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gle1Q8R322 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gle1Q8R322 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gle1Q8R322 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gle1Q8R322 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gle1Q8R322 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gle1Q8R322 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gle1Q8R322 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gle1Q8R322 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gle1Q8R322 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gle1Q8R322 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gle1Q8R322 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gle1Q8R322 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gle1Q8R322 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gle1Q8R322 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gle1Q8R322 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gle1Q8R322 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gle1Q8R322 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gle1Q8R322 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gle1Q8R322 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms