Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
OptnQ8K3K8 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
OptnQ8K3K8 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
OptnQ8K3K8 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
OptnQ8K3K8 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
OptnQ8K3K8 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
OptnQ8K3K8 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
OptnQ8K3K8 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
OptnQ8K3K8 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
OptnQ8K3K8 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
OptnQ8K3K8 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
OptnQ8K3K8 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
OptnQ8K3K8 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
OptnQ8K3K8 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
OptnQ8K3K8 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
OptnQ8K3K8 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
OptnQ8K3K8 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
OptnQ8K3K8 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
OptnQ8K3K8 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
OptnQ8K3K8 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
OptnQ8K3K8 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
OptnQ8K3K8 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
OptnQ8K3K8 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
OptnQ8K3K8 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
OptnQ8K3K8 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
OptnQ8K3K8 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
OptnQ8K3K8 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
OptnQ8K3K8 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
OptnQ8K3K8 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
OptnQ8K3K8 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
OptnQ8K3K8 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
OptnQ8K3K8 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
OptnQ8K3K8 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
OptnQ8K3K8 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
OptnQ8K3K8 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
OptnQ8K3K8 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
OptnQ8K3K8 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
OptnQ8K3K8 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
OptnQ8K3K8 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
OptnQ8K3K8 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
OptnQ8K3K8 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
OptnQ8K3K8 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
OptnQ8K3K8 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
OptnQ8K3K8 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
OptnQ8K3K8 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
OptnQ8K3K8 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
OptnQ8K3K8 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
OptnQ8K3K8 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
OptnQ8K3K8 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
OptnQ8K3K8 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
OptnQ8K3K8 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
OptnQ8K3K8 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
OptnQ8K3K8 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
OptnQ8K3K8 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
OptnQ8K3K8 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
OptnQ8K3K8 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
OptnQ8K3K8 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
OptnQ8K3K8 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
OptnQ8K3K8 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
OptnQ8K3K8 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
OptnQ8K3K8 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
OptnQ8K3K8 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
OptnQ8K3K8 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
OptnQ8K3K8 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
OptnQ8K3K8 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
OptnQ8K3K8 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
OptnQ8K3K8 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
OptnQ8K3K8 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
OptnQ8K3K8 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
OptnQ8K3K8 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
OptnQ8K3K8 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
OptnQ8K3K8 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
OptnQ8K3K8 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
OptnQ8K3K8 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
OptnQ8K3K8 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
OptnQ8K3K8 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
OptnQ8K3K8 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
OptnQ8K3K8 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
OptnQ8K3K8 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
OptnQ8K3K8 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
OptnQ8K3K8 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
OptnQ8K3K8 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
OptnQ8K3K8 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
OptnQ8K3K8 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
OptnQ8K3K8 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
OptnQ8K3K8 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
OptnQ8K3K8 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
OptnQ8K3K8 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
OptnQ8K3K8 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
OptnQ8K3K8 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
OptnQ8K3K8 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
OptnQ8K3K8 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
OptnQ8K3K8 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
OptnQ8K3K8 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
OptnQ8K3K8 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
OptnQ8K3K8 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
OptnQ8K3K8 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
OptnQ8K3K8 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
OptnQ8K3K8 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
OptnQ8K3K8 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms