Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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