Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Prpf39Q8K2Z2 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prpf39Q8K2Z2 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prpf39Q8K2Z2 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Prpf39Q8K2Z2 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prpf39Q8K2Z2 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Prpf39Q8K2Z2 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Prpf39Q8K2Z2 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Prpf39Q8K2Z2 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prpf39Q8K2Z2 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Prpf39Q8K2Z2 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Prpf39Q8K2Z2 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prpf39Q8K2Z2 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prpf39Q8K2Z2 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Prpf39Q8K2Z2 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prpf39Q8K2Z2 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prpf39Q8K2Z2 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Prpf39Q8K2Z2 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Prpf39Q8K2Z2 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prpf39Q8K2Z2 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prpf39Q8K2Z2 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prpf39Q8K2Z2 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Prpf39Q8K2Z2 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prpf39Q8K2Z2 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prpf39Q8K2Z2 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf39Q8K2Z2 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf39Q8K2Z2 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf39Q8K2Z2 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf39Q8K2Z2 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf39Q8K2Z2 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Prpf39Q8K2Z2 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf39Q8K2Z2 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf39Q8K2Z2 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf39Q8K2Z2 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf39Q8K2Z2 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf39Q8K2Z2 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf39Q8K2Z2 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf39Q8K2Z2 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf39Q8K2Z2 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf39Q8K2Z2 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf39Q8K2Z2 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf39Q8K2Z2 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Prpf39Q8K2Z2 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf39Q8K2Z2 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Prpf39Q8K2Z2 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf39Q8K2Z2 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf39Q8K2Z2 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf39Q8K2Z2 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf39Q8K2Z2 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf39Q8K2Z2 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf39Q8K2Z2 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf39Q8K2Z2 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms