Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2H2

Otud6b, OTU domain-containing protein 6B, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud6bQ8K2H2 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms