Protein–RNA interactions for Protein: Q8K299

Scara5, Scavenger receptor class A member 5, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scara5Q8K299 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms