Protein–RNA interactions for Protein: Q8K212

Pacs1, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, mousemouse

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Length 961 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacs1Q8K212 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pacs1Q8K212 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pacs1Q8K212 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pacs1Q8K212 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pacs1Q8K212 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pacs1Q8K212 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pacs1Q8K212 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pacs1Q8K212 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pacs1Q8K212 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pacs1Q8K212 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pacs1Q8K212 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pacs1Q8K212 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pacs1Q8K212 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pacs1Q8K212 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pacs1Q8K212 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pacs1Q8K212 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pacs1Q8K212 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Pacs1Q8K212 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pacs1Q8K212 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pacs1Q8K212 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pacs1Q8K212 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pacs1Q8K212 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pacs1Q8K212 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pacs1Q8K212 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pacs1Q8K212 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pacs1Q8K212 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pacs1Q8K212 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pacs1Q8K212 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pacs1Q8K212 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pacs1Q8K212 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pacs1Q8K212 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pacs1Q8K212 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Pacs1Q8K212 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Pacs1Q8K212 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Pacs1Q8K212 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Pacs1Q8K212 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pacs1Q8K212 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pacs1Q8K212 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pacs1Q8K212 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pacs1Q8K212 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pacs1Q8K212 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pacs1Q8K212 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pacs1Q8K212 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pacs1Q8K212 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pacs1Q8K212 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pacs1Q8K212 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pacs1Q8K212 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pacs1Q8K212 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pacs1Q8K212 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pacs1Q8K212 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pacs1Q8K212 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pacs1Q8K212 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pacs1Q8K212 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pacs1Q8K212 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pacs1Q8K212 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pacs1Q8K212 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pacs1Q8K212 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pacs1Q8K212 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pacs1Q8K212 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pacs1Q8K212 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pacs1Q8K212 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pacs1Q8K212 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pacs1Q8K212 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pacs1Q8K212 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pacs1Q8K212 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pacs1Q8K212 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pacs1Q8K212 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pacs1Q8K212 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pacs1Q8K212 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Pacs1Q8K212 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pacs1Q8K212 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pacs1Q8K212 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pacs1Q8K212 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pacs1Q8K212 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pacs1Q8K212 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pacs1Q8K212 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pacs1Q8K212 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pacs1Q8K212 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pacs1Q8K212 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pacs1Q8K212 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pacs1Q8K212 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pacs1Q8K212 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pacs1Q8K212 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pacs1Q8K212 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pacs1Q8K212 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pacs1Q8K212 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pacs1Q8K212 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pacs1Q8K212 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pacs1Q8K212 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pacs1Q8K212 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pacs1Q8K212 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pacs1Q8K212 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pacs1Q8K212 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pacs1Q8K212 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pacs1Q8K212 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pacs1Q8K212 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pacs1Q8K212 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pacs1Q8K212 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pacs1Q8K212 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pacs1Q8K212 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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