Protein–RNA interactions for Protein: Q8K193

Cldn34c1, Claudin 34C1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c1Q8K193 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cldn34c1Q8K193 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cldn34c1Q8K193 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cldn34c1Q8K193 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cldn34c1Q8K193 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cldn34c1Q8K193 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cldn34c1Q8K193 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cldn34c1Q8K193 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cldn34c1Q8K193 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cldn34c1Q8K193 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cldn34c1Q8K193 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cldn34c1Q8K193 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms