Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Znf628Q8CJ78 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Znf628Q8CJ78 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Znf628Q8CJ78 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Znf628Q8CJ78 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Znf628Q8CJ78 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
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Znf628Q8CJ78 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Znf628Q8CJ78 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Znf628Q8CJ78 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Znf628Q8CJ78 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Znf628Q8CJ78 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Znf628Q8CJ78 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Znf628Q8CJ78 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
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Znf628Q8CJ78 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Znf628Q8CJ78 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Znf628Q8CJ78 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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Znf628Q8CJ78 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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Znf628Q8CJ78 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Znf628Q8CJ78 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
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Znf628Q8CJ78 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Znf628Q8CJ78 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Znf628Q8CJ78 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Znf628Q8CJ78 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Znf628Q8CJ78 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Znf628Q8CJ78 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Znf628Q8CJ78 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Znf628Q8CJ78 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Znf628Q8CJ78 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Znf628Q8CJ78 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Znf628Q8CJ78 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Znf628Q8CJ78 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Znf628Q8CJ78 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Znf628Q8CJ78 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Znf628Q8CJ78 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Znf628Q8CJ78 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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Znf628Q8CJ78 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Znf628Q8CJ78 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Znf628Q8CJ78 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Znf628Q8CJ78 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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Znf628Q8CJ78 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Znf628Q8CJ78 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Znf628Q8CJ78 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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Znf628Q8CJ78 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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Znf628Q8CJ78 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Znf628Q8CJ78 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Znf628Q8CJ78 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Znf628Q8CJ78 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Znf628Q8CJ78 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Znf628Q8CJ78 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Znf628Q8CJ78 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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Znf628Q8CJ78 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Znf628Q8CJ78 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Znf628Q8CJ78 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
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Znf628Q8CJ78 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
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Znf628Q8CJ78 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Znf628Q8CJ78 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Znf628Q8CJ78 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Znf628Q8CJ78 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Znf628Q8CJ78 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Znf628Q8CJ78 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Znf628Q8CJ78 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Znf628Q8CJ78 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Znf628Q8CJ78 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Znf628Q8CJ78 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Znf628Q8CJ78 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Znf628Q8CJ78 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Znf628Q8CJ78 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Znf628Q8CJ78 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Znf628Q8CJ78 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Znf628Q8CJ78 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Znf628Q8CJ78 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Znf628Q8CJ78 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Znf628Q8CJ78 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Znf628Q8CJ78 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Znf628Q8CJ78 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Znf628Q8CJ78 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Znf628Q8CJ78 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Znf628Q8CJ78 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Znf628Q8CJ78 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Znf628Q8CJ78 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Znf628Q8CJ78 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Znf628Q8CJ78 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Znf628Q8CJ78 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Znf628Q8CJ78 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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