Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SbsnQ8CIT9 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SbsnQ8CIT9 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SbsnQ8CIT9 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SbsnQ8CIT9 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SbsnQ8CIT9 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SbsnQ8CIT9 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SbsnQ8CIT9 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SbsnQ8CIT9 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SbsnQ8CIT9 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SbsnQ8CIT9 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SbsnQ8CIT9 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SbsnQ8CIT9 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SbsnQ8CIT9 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SbsnQ8CIT9 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SbsnQ8CIT9 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SbsnQ8CIT9 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SbsnQ8CIT9 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SbsnQ8CIT9 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SbsnQ8CIT9 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SbsnQ8CIT9 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SbsnQ8CIT9 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SbsnQ8CIT9 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SbsnQ8CIT9 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
SbsnQ8CIT9 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SbsnQ8CIT9 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SbsnQ8CIT9 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SbsnQ8CIT9 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SbsnQ8CIT9 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SbsnQ8CIT9 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SbsnQ8CIT9 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SbsnQ8CIT9 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
SbsnQ8CIT9 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SbsnQ8CIT9 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SbsnQ8CIT9 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SbsnQ8CIT9 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SbsnQ8CIT9 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SbsnQ8CIT9 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SbsnQ8CIT9 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SbsnQ8CIT9 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SbsnQ8CIT9 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SbsnQ8CIT9 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SbsnQ8CIT9 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SbsnQ8CIT9 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SbsnQ8CIT9 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SbsnQ8CIT9 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
SbsnQ8CIT9 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
SbsnQ8CIT9 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
SbsnQ8CIT9 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
SbsnQ8CIT9 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
SbsnQ8CIT9 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
SbsnQ8CIT9 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.4 ms