Protein–RNA interactions for Protein: Q8CI19

Pdgfc, Platelet-derived growth factor C, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PdgfcQ8CI19 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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PdgfcQ8CI19 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PdgfcQ8CI19 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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PdgfcQ8CI19 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PdgfcQ8CI19 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PdgfcQ8CI19 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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PdgfcQ8CI19 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfcQ8CI19 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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PdgfcQ8CI19 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PdgfcQ8CI19 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PdgfcQ8CI19 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PdgfcQ8CI19 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PdgfcQ8CI19 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PdgfcQ8CI19 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PdgfcQ8CI19 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PdgfcQ8CI19 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PdgfcQ8CI19 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PdgfcQ8CI19 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PdgfcQ8CI19 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PdgfcQ8CI19 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PdgfcQ8CI19 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PdgfcQ8CI19 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PdgfcQ8CI19 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PdgfcQ8CI19 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PdgfcQ8CI19 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PdgfcQ8CI19 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms