Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFT2

Setd1b, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd1bQ8CFT2 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Setd1bQ8CFT2 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Setd1bQ8CFT2 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Setd1bQ8CFT2 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Setd1bQ8CFT2 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Setd1bQ8CFT2 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Setd1bQ8CFT2 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Setd1bQ8CFT2 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Setd1bQ8CFT2 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Setd1bQ8CFT2 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Setd1bQ8CFT2 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Setd1bQ8CFT2 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Setd1bQ8CFT2 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Setd1bQ8CFT2 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Setd1bQ8CFT2 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Setd1bQ8CFT2 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Setd1bQ8CFT2 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Setd1bQ8CFT2 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Setd1bQ8CFT2 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Setd1bQ8CFT2 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Setd1bQ8CFT2 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Setd1bQ8CFT2 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Setd1bQ8CFT2 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Setd1bQ8CFT2 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Setd1bQ8CFT2 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Setd1bQ8CFT2 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Setd1bQ8CFT2 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Setd1bQ8CFT2 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Setd1bQ8CFT2 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Setd1bQ8CFT2 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Setd1bQ8CFT2 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Setd1bQ8CFT2 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Setd1bQ8CFT2 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Setd1bQ8CFT2 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Setd1bQ8CFT2 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Setd1bQ8CFT2 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Setd1bQ8CFT2 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Setd1bQ8CFT2 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Setd1bQ8CFT2 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Setd1bQ8CFT2 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Setd1bQ8CFT2 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Setd1bQ8CFT2 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Setd1bQ8CFT2 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Setd1bQ8CFT2 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Setd1bQ8CFT2 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Setd1bQ8CFT2 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Setd1bQ8CFT2 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Setd1bQ8CFT2 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Setd1bQ8CFT2 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Setd1bQ8CFT2 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Setd1bQ8CFT2 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Setd1bQ8CFT2 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Setd1bQ8CFT2 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Setd1bQ8CFT2 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Setd1bQ8CFT2 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Setd1bQ8CFT2 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Setd1bQ8CFT2 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Setd1bQ8CFT2 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Setd1bQ8CFT2 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Setd1bQ8CFT2 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Setd1bQ8CFT2 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Setd1bQ8CFT2 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Setd1bQ8CFT2 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Setd1bQ8CFT2 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Setd1bQ8CFT2 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Setd1bQ8CFT2 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Setd1bQ8CFT2 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Setd1bQ8CFT2 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Setd1bQ8CFT2 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Setd1bQ8CFT2 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Setd1bQ8CFT2 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Setd1bQ8CFT2 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Setd1bQ8CFT2 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Setd1bQ8CFT2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Setd1bQ8CFT2 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Setd1bQ8CFT2 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Setd1bQ8CFT2 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Setd1bQ8CFT2 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Setd1bQ8CFT2 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Setd1bQ8CFT2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Setd1bQ8CFT2 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Setd1bQ8CFT2 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Setd1bQ8CFT2 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Setd1bQ8CFT2 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Setd1bQ8CFT2 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Setd1bQ8CFT2 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Setd1bQ8CFT2 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Setd1bQ8CFT2 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Setd1bQ8CFT2 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Setd1bQ8CFT2 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Setd1bQ8CFT2 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Setd1bQ8CFT2 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Setd1bQ8CFT2 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Setd1bQ8CFT2 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Setd1bQ8CFT2 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Setd1bQ8CFT2 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Setd1bQ8CFT2 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Setd1bQ8CFT2 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Setd1bQ8CFT2 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Setd1bQ8CFT2 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
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