Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDL9

Ccdc87, Coiled-coil domain-containing protein 87, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc87Q8CDL9 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms