Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Nhlrc3Q8CCH2 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
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