Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBD1

Nrip1, Nuclear receptor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrip1Q8CBD1 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nrip1Q8CBD1 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nrip1Q8CBD1 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nrip1Q8CBD1 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nrip1Q8CBD1 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nrip1Q8CBD1 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nrip1Q8CBD1 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms