Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Atg4aQ8C9S8 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atg4aQ8C9S8 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atg4aQ8C9S8 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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Atg4aQ8C9S8 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atg4aQ8C9S8 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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Atg4aQ8C9S8 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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Atg4aQ8C9S8 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms