Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6J9

Nlrp4b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4bQ8C6J9 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nlrp4bQ8C6J9 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nlrp4bQ8C6J9 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nlrp4bQ8C6J9 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nlrp4bQ8C6J9 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nlrp4bQ8C6J9 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Nlrp4bQ8C6J9 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Nlrp4bQ8C6J9 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Nlrp4bQ8C6J9 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
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Nlrp4bQ8C6J9 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nlrp4bQ8C6J9 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Nlrp4bQ8C6J9 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Nlrp4bQ8C6J9 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Nlrp4bQ8C6J9 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Nlrp4bQ8C6J9 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nlrp4bQ8C6J9 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nlrp4bQ8C6J9 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nlrp4bQ8C6J9 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Nlrp4bQ8C6J9 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nlrp4bQ8C6J9 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Nlrp4bQ8C6J9 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nlrp4bQ8C6J9 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Nlrp4bQ8C6J9 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Nlrp4bQ8C6J9 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nlrp4bQ8C6J9 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nlrp4bQ8C6J9 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Nlrp4bQ8C6J9 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nlrp4bQ8C6J9 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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Nlrp4bQ8C6J9 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms