Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5L3

Cnot2, CCR4-NOT transcription complex subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot2Q8C5L3 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms