Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5C9

TPA-induced transmembrane protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C5C9 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q8C5C9 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q8C5C9 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q8C5C9 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q8C5C9 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q8C5C9 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q8C5C9 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Q8C5C9 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q8C5C9 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q8C5C9 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q8C5C9 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q8C5C9 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q8C5C9 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q8C5C9 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q8C5C9 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q8C5C9 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Q8C5C9 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q8C5C9 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q8C5C9 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q8C5C9 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q8C5C9 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q8C5C9 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q8C5C9 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q8C5C9 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q8C5C9 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Q8C5C9 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q8C5C9 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q8C5C9 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q8C5C9 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Q8C5C9 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q8C5C9 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q8C5C9 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q8C5C9 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q8C5C9 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q8C5C9 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Q8C5C9 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Q8C5C9 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q8C5C9 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q8C5C9 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q8C5C9 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q8C5C9 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q8C5C9 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q8C5C9 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q8C5C9 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q8C5C9 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q8C5C9 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q8C5C9 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q8C5C9 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q8C5C9 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q8C5C9 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8C5C9 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8C5C9 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8C5C9 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8C5C9 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8C5C9 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8C5C9 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8C5C9 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8C5C9 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8C5C9 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8C5C9 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8C5C9 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8C5C9 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8C5C9 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8C5C9 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8C5C9 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8C5C9 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8C5C9 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8C5C9 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8C5C9 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8C5C9 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8C5C9 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8C5C9 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8C5C9 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8C5C9 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8C5C9 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8C5C9 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8C5C9 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8C5C9 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8C5C9 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8C5C9 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8C5C9 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8C5C9 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8C5C9 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8C5C9 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8C5C9 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8C5C9 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8C5C9 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8C5C9 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8C5C9 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8C5C9 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8C5C9 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8C5C9 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8C5C9 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8C5C9 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8C5C9 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8C5C9 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8C5C9 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8C5C9 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8C5C9 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8C5C9 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms