Protein–RNA interactions for Protein: Q8BU04

Ubr7, Putative E3 ubiquitin-protein ligase UBR7, mousemouse

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Length 425 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubr7Q8BU04 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
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Ubr7Q8BU04 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubr7Q8BU04 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubr7Q8BU04 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubr7Q8BU04 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubr7Q8BU04 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubr7Q8BU04 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubr7Q8BU04 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubr7Q8BU04 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubr7Q8BU04 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubr7Q8BU04 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubr7Q8BU04 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubr7Q8BU04 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubr7Q8BU04 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubr7Q8BU04 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubr7Q8BU04 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubr7Q8BU04 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubr7Q8BU04 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubr7Q8BU04 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubr7Q8BU04 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubr7Q8BU04 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubr7Q8BU04 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Ubr7Q8BU04 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubr7Q8BU04 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubr7Q8BU04 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubr7Q8BU04 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubr7Q8BU04 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubr7Q8BU04 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubr7Q8BU04 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubr7Q8BU04 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubr7Q8BU04 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Ubr7Q8BU04 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubr7Q8BU04 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubr7Q8BU04 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubr7Q8BU04 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Ubr7Q8BU04 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubr7Q8BU04 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubr7Q8BU04 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubr7Q8BU04 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubr7Q8BU04 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubr7Q8BU04 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubr7Q8BU04 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Ubr7Q8BU04 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubr7Q8BU04 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubr7Q8BU04 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubr7Q8BU04 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubr7Q8BU04 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubr7Q8BU04 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubr7Q8BU04 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Ubr7Q8BU04 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubr7Q8BU04 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubr7Q8BU04 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubr7Q8BU04 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Ubr7Q8BU04 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Ubr7Q8BU04 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubr7Q8BU04 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Ubr7Q8BU04 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubr7Q8BU04 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubr7Q8BU04 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubr7Q8BU04 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubr7Q8BU04 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubr7Q8BU04 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubr7Q8BU04 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubr7Q8BU04 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubr7Q8BU04 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubr7Q8BU04 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubr7Q8BU04 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Ubr7Q8BU04 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubr7Q8BU04 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubr7Q8BU04 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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