Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMF5

Grik4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik4Q8BMF5 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Grik4Q8BMF5 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Grik4Q8BMF5 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Grik4Q8BMF5 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Grik4Q8BMF5 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Grik4Q8BMF5 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Grik4Q8BMF5 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Grik4Q8BMF5 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Grik4Q8BMF5 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Grik4Q8BMF5 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Grik4Q8BMF5 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Grik4Q8BMF5 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Grik4Q8BMF5 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms