Protein–RNA interactions for Protein: Q8BK35

Nop53, Ribosome biogenesis protein NOP53, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop53Q8BK35 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nop53Q8BK35 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nop53Q8BK35 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nop53Q8BK35 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nop53Q8BK35 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nop53Q8BK35 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nop53Q8BK35 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nop53Q8BK35 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Nop53Q8BK35 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nop53Q8BK35 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nop53Q8BK35 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nop53Q8BK35 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nop53Q8BK35 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nop53Q8BK35 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nop53Q8BK35 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nop53Q8BK35 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nop53Q8BK35 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nop53Q8BK35 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nop53Q8BK35 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nop53Q8BK35 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nop53Q8BK35 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nop53Q8BK35 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nop53Q8BK35 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nop53Q8BK35 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nop53Q8BK35 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Nop53Q8BK35 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Nop53Q8BK35 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nop53Q8BK35 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nop53Q8BK35 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nop53Q8BK35 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nop53Q8BK35 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nop53Q8BK35 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nop53Q8BK35 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Nop53Q8BK35 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Nop53Q8BK35 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Nop53Q8BK35 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Nop53Q8BK35 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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