Protein–RNA interactions for Protein: Q8BII3

D130040H23Rik, RIKEN cDNA D130040H23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130040H23RikQ8BII3 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
D130040H23RikQ8BII3 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
D130040H23RikQ8BII3 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
D130040H23RikQ8BII3 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
D130040H23RikQ8BII3 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
D130040H23RikQ8BII3 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
D130040H23RikQ8BII3 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
D130040H23RikQ8BII3 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
D130040H23RikQ8BII3 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
D130040H23RikQ8BII3 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
D130040H23RikQ8BII3 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
D130040H23RikQ8BII3 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
D130040H23RikQ8BII3 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
D130040H23RikQ8BII3 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
D130040H23RikQ8BII3 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
D130040H23RikQ8BII3 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
D130040H23RikQ8BII3 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
D130040H23RikQ8BII3 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
D130040H23RikQ8BII3 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
D130040H23RikQ8BII3 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
D130040H23RikQ8BII3 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
D130040H23RikQ8BII3 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
D130040H23RikQ8BII3 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
D130040H23RikQ8BII3 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
D130040H23RikQ8BII3 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
D130040H23RikQ8BII3 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
D130040H23RikQ8BII3 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
D130040H23RikQ8BII3 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
D130040H23RikQ8BII3 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
D130040H23RikQ8BII3 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
D130040H23RikQ8BII3 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
D130040H23RikQ8BII3 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
D130040H23RikQ8BII3 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
D130040H23RikQ8BII3 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
D130040H23RikQ8BII3 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
D130040H23RikQ8BII3 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
D130040H23RikQ8BII3 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
D130040H23RikQ8BII3 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
D130040H23RikQ8BII3 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
D130040H23RikQ8BII3 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
D130040H23RikQ8BII3 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
D130040H23RikQ8BII3 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
D130040H23RikQ8BII3 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
D130040H23RikQ8BII3 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
D130040H23RikQ8BII3 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
D130040H23RikQ8BII3 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
D130040H23RikQ8BII3 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
D130040H23RikQ8BII3 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
D130040H23RikQ8BII3 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
D130040H23RikQ8BII3 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
D130040H23RikQ8BII3 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
D130040H23RikQ8BII3 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
D130040H23RikQ8BII3 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
D130040H23RikQ8BII3 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
D130040H23RikQ8BII3 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
D130040H23RikQ8BII3 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
D130040H23RikQ8BII3 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
D130040H23RikQ8BII3 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
D130040H23RikQ8BII3 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
D130040H23RikQ8BII3 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
D130040H23RikQ8BII3 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
D130040H23RikQ8BII3 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
D130040H23RikQ8BII3 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
D130040H23RikQ8BII3 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
D130040H23RikQ8BII3 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
D130040H23RikQ8BII3 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
D130040H23RikQ8BII3 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
D130040H23RikQ8BII3 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
D130040H23RikQ8BII3 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
D130040H23RikQ8BII3 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
D130040H23RikQ8BII3 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
D130040H23RikQ8BII3 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
D130040H23RikQ8BII3 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
D130040H23RikQ8BII3 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
D130040H23RikQ8BII3 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
D130040H23RikQ8BII3 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
D130040H23RikQ8BII3 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
D130040H23RikQ8BII3 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
D130040H23RikQ8BII3 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
D130040H23RikQ8BII3 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
D130040H23RikQ8BII3 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
D130040H23RikQ8BII3 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
D130040H23RikQ8BII3 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
D130040H23RikQ8BII3 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
D130040H23RikQ8BII3 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
D130040H23RikQ8BII3 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
D130040H23RikQ8BII3 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
D130040H23RikQ8BII3 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
D130040H23RikQ8BII3 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
D130040H23RikQ8BII3 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
D130040H23RikQ8BII3 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
D130040H23RikQ8BII3 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
D130040H23RikQ8BII3 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
D130040H23RikQ8BII3 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
D130040H23RikQ8BII3 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
D130040H23RikQ8BII3 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
D130040H23RikQ8BII3 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
D130040H23RikQ8BII3 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
D130040H23RikQ8BII3 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
D130040H23RikQ8BII3 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms