Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

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Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Atg4bQ8BGE6 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Atg4bQ8BGE6 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Atg4bQ8BGE6 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Atg4bQ8BGE6 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Atg4bQ8BGE6 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Atg4bQ8BGE6 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Atg4bQ8BGE6 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Atg4bQ8BGE6 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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