Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFW4

Trim65, Tripartite motif-containing protein 65, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim65Q8BFW4 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim65Q8BFW4 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim65Q8BFW4 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim65Q8BFW4 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim65Q8BFW4 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim65Q8BFW4 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim65Q8BFW4 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim65Q8BFW4 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim65Q8BFW4 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim65Q8BFW4 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim65Q8BFW4 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim65Q8BFW4 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim65Q8BFW4 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim65Q8BFW4 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim65Q8BFW4 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim65Q8BFW4 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim65Q8BFW4 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim65Q8BFW4 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim65Q8BFW4 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim65Q8BFW4 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim65Q8BFW4 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim65Q8BFW4 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim65Q8BFW4 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim65Q8BFW4 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim65Q8BFW4 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim65Q8BFW4 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim65Q8BFW4 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim65Q8BFW4 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim65Q8BFW4 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim65Q8BFW4 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim65Q8BFW4 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim65Q8BFW4 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim65Q8BFW4 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim65Q8BFW4 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim65Q8BFW4 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim65Q8BFW4 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim65Q8BFW4 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim65Q8BFW4 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim65Q8BFW4 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim65Q8BFW4 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim65Q8BFW4 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim65Q8BFW4 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim65Q8BFW4 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim65Q8BFW4 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim65Q8BFW4 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim65Q8BFW4 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim65Q8BFW4 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim65Q8BFW4 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim65Q8BFW4 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim65Q8BFW4 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim65Q8BFW4 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim65Q8BFW4 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim65Q8BFW4 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim65Q8BFW4 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim65Q8BFW4 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim65Q8BFW4 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim65Q8BFW4 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim65Q8BFW4 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim65Q8BFW4 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim65Q8BFW4 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim65Q8BFW4 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim65Q8BFW4 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim65Q8BFW4 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim65Q8BFW4 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim65Q8BFW4 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim65Q8BFW4 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim65Q8BFW4 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim65Q8BFW4 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim65Q8BFW4 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim65Q8BFW4 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim65Q8BFW4 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim65Q8BFW4 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim65Q8BFW4 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim65Q8BFW4 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim65Q8BFW4 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim65Q8BFW4 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim65Q8BFW4 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim65Q8BFW4 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim65Q8BFW4 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim65Q8BFW4 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim65Q8BFW4 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim65Q8BFW4 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim65Q8BFW4 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim65Q8BFW4 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim65Q8BFW4 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim65Q8BFW4 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim65Q8BFW4 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim65Q8BFW4 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim65Q8BFW4 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim65Q8BFW4 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim65Q8BFW4 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim65Q8BFW4 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim65Q8BFW4 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim65Q8BFW4 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim65Q8BFW4 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim65Q8BFW4 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim65Q8BFW4 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim65Q8BFW4 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim65Q8BFW4 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim65Q8BFW4 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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