Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFT6

Jmjd4, JmjC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd4Q8BFT6 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Jmjd4Q8BFT6 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Jmjd4Q8BFT6 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Jmjd4Q8BFT6 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Jmjd4Q8BFT6 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Jmjd4Q8BFT6 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Jmjd4Q8BFT6 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Jmjd4Q8BFT6 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Jmjd4Q8BFT6 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Jmjd4Q8BFT6 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Jmjd4Q8BFT6 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Jmjd4Q8BFT6 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Jmjd4Q8BFT6 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Jmjd4Q8BFT6 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Jmjd4Q8BFT6 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Jmjd4Q8BFT6 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Jmjd4Q8BFT6 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Jmjd4Q8BFT6 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Jmjd4Q8BFT6 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Jmjd4Q8BFT6 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Jmjd4Q8BFT6 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Jmjd4Q8BFT6 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Jmjd4Q8BFT6 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Jmjd4Q8BFT6 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Jmjd4Q8BFT6 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Jmjd4Q8BFT6 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Jmjd4Q8BFT6 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Jmjd4Q8BFT6 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Jmjd4Q8BFT6 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Jmjd4Q8BFT6 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Jmjd4Q8BFT6 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Jmjd4Q8BFT6 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Jmjd4Q8BFT6 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Jmjd4Q8BFT6 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Jmjd4Q8BFT6 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Jmjd4Q8BFT6 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Jmjd4Q8BFT6 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Jmjd4Q8BFT6 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Jmjd4Q8BFT6 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Jmjd4Q8BFT6 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Jmjd4Q8BFT6 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Jmjd4Q8BFT6 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Jmjd4Q8BFT6 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Jmjd4Q8BFT6 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Jmjd4Q8BFT6 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Jmjd4Q8BFT6 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Jmjd4Q8BFT6 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Jmjd4Q8BFT6 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Jmjd4Q8BFT6 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Jmjd4Q8BFT6 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Jmjd4Q8BFT6 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Jmjd4Q8BFT6 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Jmjd4Q8BFT6 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Jmjd4Q8BFT6 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Jmjd4Q8BFT6 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Jmjd4Q8BFT6 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Jmjd4Q8BFT6 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Jmjd4Q8BFT6 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Jmjd4Q8BFT6 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Jmjd4Q8BFT6 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Jmjd4Q8BFT6 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Jmjd4Q8BFT6 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Jmjd4Q8BFT6 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Jmjd4Q8BFT6 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Jmjd4Q8BFT6 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Jmjd4Q8BFT6 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Jmjd4Q8BFT6 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Jmjd4Q8BFT6 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Jmjd4Q8BFT6 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Jmjd4Q8BFT6 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Jmjd4Q8BFT6 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Jmjd4Q8BFT6 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Jmjd4Q8BFT6 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Jmjd4Q8BFT6 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Jmjd4Q8BFT6 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Jmjd4Q8BFT6 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Jmjd4Q8BFT6 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Jmjd4Q8BFT6 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Jmjd4Q8BFT6 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Jmjd4Q8BFT6 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Jmjd4Q8BFT6 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Jmjd4Q8BFT6 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Jmjd4Q8BFT6 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Jmjd4Q8BFT6 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Jmjd4Q8BFT6 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Jmjd4Q8BFT6 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Jmjd4Q8BFT6 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Jmjd4Q8BFT6 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Jmjd4Q8BFT6 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Jmjd4Q8BFT6 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Jmjd4Q8BFT6 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Jmjd4Q8BFT6 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Jmjd4Q8BFT6 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Jmjd4Q8BFT6 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Jmjd4Q8BFT6 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Jmjd4Q8BFT6 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Jmjd4Q8BFT6 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Jmjd4Q8BFT6 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Jmjd4Q8BFT6 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Jmjd4Q8BFT6 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms