Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Ttc28Q80XJ3 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ttc28Q80XJ3 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ttc28Q80XJ3 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ttc28Q80XJ3 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ttc28Q80XJ3 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Ttc28Q80XJ3 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Ttc28Q80XJ3 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Ttc28Q80XJ3 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Ttc28Q80XJ3 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ttc28Q80XJ3 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ttc28Q80XJ3 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ttc28Q80XJ3 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Ttc28Q80XJ3 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ttc28Q80XJ3 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ttc28Q80XJ3 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ttc28Q80XJ3 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ttc28Q80XJ3 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ttc28Q80XJ3 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ttc28Q80XJ3 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ttc28Q80XJ3 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ttc28Q80XJ3 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ttc28Q80XJ3 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ttc28Q80XJ3 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ttc28Q80XJ3 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ttc28Q80XJ3 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ttc28Q80XJ3 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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