Protein–RNA interactions for Protein: Q80W85

Npm2, Nucleoplasmin-2, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm2Q80W85 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Npm2Q80W85 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Npm2Q80W85 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Npm2Q80W85 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Npm2Q80W85 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Npm2Q80W85 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Npm2Q80W85 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Npm2Q80W85 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Npm2Q80W85 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Npm2Q80W85 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Npm2Q80W85 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Npm2Q80W85 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Npm2Q80W85 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Npm2Q80W85 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Npm2Q80W85 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Npm2Q80W85 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Npm2Q80W85 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Npm2Q80W85 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Npm2Q80W85 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Npm2Q80W85 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Npm2Q80W85 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Npm2Q80W85 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Npm2Q80W85 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Npm2Q80W85 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Npm2Q80W85 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Npm2Q80W85 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Npm2Q80W85 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Npm2Q80W85 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Npm2Q80W85 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Npm2Q80W85 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Npm2Q80W85 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Npm2Q80W85 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Npm2Q80W85 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Npm2Q80W85 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Npm2Q80W85 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Npm2Q80W85 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Npm2Q80W85 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Npm2Q80W85 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Npm2Q80W85 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Npm2Q80W85 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Npm2Q80W85 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Npm2Q80W85 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Npm2Q80W85 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Npm2Q80W85 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Npm2Q80W85 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Npm2Q80W85 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Npm2Q80W85 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Npm2Q80W85 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Npm2Q80W85 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Npm2Q80W85 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Npm2Q80W85 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Npm2Q80W85 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Npm2Q80W85 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Npm2Q80W85 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Npm2Q80W85 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Npm2Q80W85 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Npm2Q80W85 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Npm2Q80W85 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Npm2Q80W85 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Npm2Q80W85 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Npm2Q80W85 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Npm2Q80W85 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Npm2Q80W85 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Npm2Q80W85 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Npm2Q80W85 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Npm2Q80W85 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Npm2Q80W85 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Npm2Q80W85 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Npm2Q80W85 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Npm2Q80W85 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Npm2Q80W85 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Npm2Q80W85 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Npm2Q80W85 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Npm2Q80W85 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Npm2Q80W85 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Npm2Q80W85 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Npm2Q80W85 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Npm2Q80W85 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Npm2Q80W85 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Npm2Q80W85 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Npm2Q80W85 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Npm2Q80W85 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Npm2Q80W85 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Npm2Q80W85 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Npm2Q80W85 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Npm2Q80W85 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Npm2Q80W85 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Npm2Q80W85 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Npm2Q80W85 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Npm2Q80W85 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Npm2Q80W85 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Npm2Q80W85 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Npm2Q80W85 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Npm2Q80W85 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Npm2Q80W85 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Npm2Q80W85 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Npm2Q80W85 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Npm2Q80W85 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Npm2Q80W85 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Npm2Q80W85 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms