Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ1

Lrrc1, Leucine-rich repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc1Q80VQ1 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc1Q80VQ1 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc1Q80VQ1 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc1Q80VQ1 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc1Q80VQ1 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc1Q80VQ1 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc1Q80VQ1 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc1Q80VQ1 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc1Q80VQ1 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc1Q80VQ1 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc1Q80VQ1 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc1Q80VQ1 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc1Q80VQ1 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc1Q80VQ1 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc1Q80VQ1 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc1Q80VQ1 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc1Q80VQ1 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc1Q80VQ1 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc1Q80VQ1 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc1Q80VQ1 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc1Q80VQ1 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc1Q80VQ1 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc1Q80VQ1 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc1Q80VQ1 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc1Q80VQ1 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc1Q80VQ1 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc1Q80VQ1 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc1Q80VQ1 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc1Q80VQ1 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc1Q80VQ1 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc1Q80VQ1 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc1Q80VQ1 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc1Q80VQ1 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc1Q80VQ1 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc1Q80VQ1 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc1Q80VQ1 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc1Q80VQ1 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc1Q80VQ1 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc1Q80VQ1 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc1Q80VQ1 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc1Q80VQ1 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc1Q80VQ1 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc1Q80VQ1 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc1Q80VQ1 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc1Q80VQ1 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc1Q80VQ1 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc1Q80VQ1 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc1Q80VQ1 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc1Q80VQ1 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc1Q80VQ1 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc1Q80VQ1 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc1Q80VQ1 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc1Q80VQ1 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc1Q80VQ1 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc1Q80VQ1 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc1Q80VQ1 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc1Q80VQ1 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc1Q80VQ1 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc1Q80VQ1 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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