Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNK4

Zfp397, Zinc finger protein 397, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp397Q7TNK4 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms