Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnih3Q6ZWS4 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnih3Q6ZWS4 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnih3Q6ZWS4 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnih3Q6ZWS4 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnih3Q6ZWS4 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnih3Q6ZWS4 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnih3Q6ZWS4 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnih3Q6ZWS4 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnih3Q6ZWS4 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnih3Q6ZWS4 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnih3Q6ZWS4 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnih3Q6ZWS4 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnih3Q6ZWS4 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnih3Q6ZWS4 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnih3Q6ZWS4 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnih3Q6ZWS4 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnih3Q6ZWS4 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.4□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms