Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE3

Rad54b, DNA repair and recombination protein RAD54B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54bQ6PFE3 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rad54bQ6PFE3 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rad54bQ6PFE3 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rad54bQ6PFE3 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rad54bQ6PFE3 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rad54bQ6PFE3 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rad54bQ6PFE3 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rad54bQ6PFE3 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rad54bQ6PFE3 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rad54bQ6PFE3 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rad54bQ6PFE3 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rad54bQ6PFE3 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rad54bQ6PFE3 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rad54bQ6PFE3 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rad54bQ6PFE3 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rad54bQ6PFE3 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rad54bQ6PFE3 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rad54bQ6PFE3 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rad54bQ6PFE3 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms