Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1D7

Slx4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, mousemouse

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4Q6P1D7 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slx4Q6P1D7 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slx4Q6P1D7 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slx4Q6P1D7 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slx4Q6P1D7 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slx4Q6P1D7 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slx4Q6P1D7 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slx4Q6P1D7 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slx4Q6P1D7 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slx4Q6P1D7 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slx4Q6P1D7 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slx4Q6P1D7 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Slx4Q6P1D7 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slx4Q6P1D7 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slx4Q6P1D7 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slx4Q6P1D7 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slx4Q6P1D7 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slx4Q6P1D7 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slx4Q6P1D7 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slx4Q6P1D7 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slx4Q6P1D7 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slx4Q6P1D7 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slx4Q6P1D7 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slx4Q6P1D7 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slx4Q6P1D7 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slx4Q6P1D7 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slx4Q6P1D7 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slx4Q6P1D7 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slx4Q6P1D7 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slx4Q6P1D7 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slx4Q6P1D7 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slx4Q6P1D7 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slx4Q6P1D7 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Slx4Q6P1D7 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slx4Q6P1D7 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slx4Q6P1D7 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slx4Q6P1D7 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slx4Q6P1D7 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slx4Q6P1D7 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slx4Q6P1D7 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slx4Q6P1D7 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slx4Q6P1D7 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slx4Q6P1D7 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slx4Q6P1D7 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slx4Q6P1D7 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slx4Q6P1D7 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slx4Q6P1D7 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slx4Q6P1D7 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Slx4Q6P1D7 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slx4Q6P1D7 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slx4Q6P1D7 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slx4Q6P1D7 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slx4Q6P1D7 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slx4Q6P1D7 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slx4Q6P1D7 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slx4Q6P1D7 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slx4Q6P1D7 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Slx4Q6P1D7 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slx4Q6P1D7 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slx4Q6P1D7 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slx4Q6P1D7 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slx4Q6P1D7 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slx4Q6P1D7 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Slx4Q6P1D7 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slx4Q6P1D7 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slx4Q6P1D7 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Slx4Q6P1D7 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slx4Q6P1D7 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slx4Q6P1D7 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slx4Q6P1D7 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slx4Q6P1D7 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Slx4Q6P1D7 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slx4Q6P1D7 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Slx4Q6P1D7 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slx4Q6P1D7 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slx4Q6P1D7 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slx4Q6P1D7 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slx4Q6P1D7 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slx4Q6P1D7 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slx4Q6P1D7 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slx4Q6P1D7 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slx4Q6P1D7 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slx4Q6P1D7 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slx4Q6P1D7 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slx4Q6P1D7 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slx4Q6P1D7 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slx4Q6P1D7 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slx4Q6P1D7 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Slx4Q6P1D7 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Slx4Q6P1D7 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slx4Q6P1D7 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slx4Q6P1D7 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slx4Q6P1D7 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slx4Q6P1D7 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slx4Q6P1D7 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slx4Q6P1D7 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slx4Q6P1D7 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Slx4Q6P1D7 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Slx4Q6P1D7 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slx4Q6P1D7 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.5 ms