Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CltbQ6IRU5 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CltbQ6IRU5 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CltbQ6IRU5 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CltbQ6IRU5 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CltbQ6IRU5 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CltbQ6IRU5 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CltbQ6IRU5 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CltbQ6IRU5 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CltbQ6IRU5 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CltbQ6IRU5 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CltbQ6IRU5 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CltbQ6IRU5 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CltbQ6IRU5 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CltbQ6IRU5 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CltbQ6IRU5 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CltbQ6IRU5 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CltbQ6IRU5 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CltbQ6IRU5 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CltbQ6IRU5 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CltbQ6IRU5 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CltbQ6IRU5 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CltbQ6IRU5 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CltbQ6IRU5 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CltbQ6IRU5 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CltbQ6IRU5 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CltbQ6IRU5 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CltbQ6IRU5 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CltbQ6IRU5 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CltbQ6IRU5 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CltbQ6IRU5 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CltbQ6IRU5 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CltbQ6IRU5 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CltbQ6IRU5 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CltbQ6IRU5 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CltbQ6IRU5 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CltbQ6IRU5 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CltbQ6IRU5 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CltbQ6IRU5 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CltbQ6IRU5 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CltbQ6IRU5 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CltbQ6IRU5 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CltbQ6IRU5 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CltbQ6IRU5 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CltbQ6IRU5 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CltbQ6IRU5 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CltbQ6IRU5 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CltbQ6IRU5 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CltbQ6IRU5 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CltbQ6IRU5 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CltbQ6IRU5 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CltbQ6IRU5 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CltbQ6IRU5 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CltbQ6IRU5 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CltbQ6IRU5 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CltbQ6IRU5 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CltbQ6IRU5 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CltbQ6IRU5 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CltbQ6IRU5 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CltbQ6IRU5 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CltbQ6IRU5 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CltbQ6IRU5 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CltbQ6IRU5 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CltbQ6IRU5 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CltbQ6IRU5 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CltbQ6IRU5 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CltbQ6IRU5 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CltbQ6IRU5 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CltbQ6IRU5 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CltbQ6IRU5 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CltbQ6IRU5 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CltbQ6IRU5 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CltbQ6IRU5 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CltbQ6IRU5 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CltbQ6IRU5 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms