Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Smarca2Q6DIC0 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Smarca2Q6DIC0 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Smarca2Q6DIC0 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Smarca2Q6DIC0 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Smarca2Q6DIC0 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Smarca2Q6DIC0 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Smarca2Q6DIC0 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Smarca2Q6DIC0 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Smarca2Q6DIC0 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Smarca2Q6DIC0 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Smarca2Q6DIC0 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Smarca2Q6DIC0 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Smarca2Q6DIC0 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Smarca2Q6DIC0 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Smarca2Q6DIC0 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Smarca2Q6DIC0 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Smarca2Q6DIC0 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Smarca2Q6DIC0 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Smarca2Q6DIC0 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Smarca2Q6DIC0 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Smarca2Q6DIC0 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Smarca2Q6DIC0 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Smarca2Q6DIC0 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Smarca2Q6DIC0 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Smarca2Q6DIC0 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Smarca2Q6DIC0 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Smarca2Q6DIC0 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Smarca2Q6DIC0 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Smarca2Q6DIC0 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Smarca2Q6DIC0 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Smarca2Q6DIC0 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Smarca2Q6DIC0 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Smarca2Q6DIC0 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Smarca2Q6DIC0 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Smarca2Q6DIC0 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Smarca2Q6DIC0 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Smarca2Q6DIC0 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Smarca2Q6DIC0 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Smarca2Q6DIC0 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Smarca2Q6DIC0 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Smarca2Q6DIC0 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Smarca2Q6DIC0 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smarca2Q6DIC0 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Smarca2Q6DIC0 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Smarca2Q6DIC0 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smarca2Q6DIC0 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smarca2Q6DIC0 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smarca2Q6DIC0 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smarca2Q6DIC0 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smarca2Q6DIC0 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Smarca2Q6DIC0 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smarca2Q6DIC0 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smarca2Q6DIC0 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smarca2Q6DIC0 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smarca2Q6DIC0 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smarca2Q6DIC0 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smarca2Q6DIC0 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smarca2Q6DIC0 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smarca2Q6DIC0 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smarca2Q6DIC0 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smarca2Q6DIC0 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smarca2Q6DIC0 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smarca2Q6DIC0 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Smarca2Q6DIC0 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Smarca2Q6DIC0 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Smarca2Q6DIC0 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Smarca2Q6DIC0 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Smarca2Q6DIC0 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Smarca2Q6DIC0 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Smarca2Q6DIC0 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Smarca2Q6DIC0 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Smarca2Q6DIC0 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Smarca2Q6DIC0 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Smarca2Q6DIC0 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Smarca2Q6DIC0 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Smarca2Q6DIC0 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Smarca2Q6DIC0 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Smarca2Q6DIC0 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Smarca2Q6DIC0 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Smarca2Q6DIC0 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Smarca2Q6DIC0 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Smarca2Q6DIC0 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Smarca2Q6DIC0 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Smarca2Q6DIC0 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Smarca2Q6DIC0 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Smarca2Q6DIC0 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Smarca2Q6DIC0 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Smarca2Q6DIC0 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Smarca2Q6DIC0 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Smarca2Q6DIC0 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Smarca2Q6DIC0 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Smarca2Q6DIC0 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Smarca2Q6DIC0 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Smarca2Q6DIC0 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Smarca2Q6DIC0 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Smarca2Q6DIC0 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Smarca2Q6DIC0 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Smarca2Q6DIC0 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Smarca2Q6DIC0 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 256.1 ms