Protein–RNA interactions for Protein: Q64253

Ly6e, Lymphocyte antigen 6E, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6eQ64253 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ly6eQ64253 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ly6eQ64253 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ly6eQ64253 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ly6eQ64253 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ly6eQ64253 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ly6eQ64253 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ly6eQ64253 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ly6eQ64253 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ly6eQ64253 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ly6eQ64253 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ly6eQ64253 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ly6eQ64253 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ly6eQ64253 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ly6eQ64253 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ly6eQ64253 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ly6eQ64253 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ly6eQ64253 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ly6eQ64253 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ly6eQ64253 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ly6eQ64253 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ly6eQ64253 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ly6eQ64253 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ly6eQ64253 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ly6eQ64253 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ly6eQ64253 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ly6eQ64253 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ly6eQ64253 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ly6eQ64253 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ly6eQ64253 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ly6eQ64253 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ly6eQ64253 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ly6eQ64253 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ly6eQ64253 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ly6eQ64253 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ly6eQ64253 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ly6eQ64253 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ly6eQ64253 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ly6eQ64253 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ly6eQ64253 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ly6eQ64253 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ly6eQ64253 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ly6eQ64253 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ly6eQ64253 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ly6eQ64253 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ly6eQ64253 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ly6eQ64253 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ly6eQ64253 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ly6eQ64253 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ly6eQ64253 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ly6eQ64253 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ly6eQ64253 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ly6eQ64253 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ly6eQ64253 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ly6eQ64253 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ly6eQ64253 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ly6eQ64253 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ly6eQ64253 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ly6eQ64253 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ly6eQ64253 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ly6eQ64253 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ly6eQ64253 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ly6eQ64253 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ly6eQ64253 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ly6eQ64253 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ly6eQ64253 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ly6eQ64253 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ly6eQ64253 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ly6eQ64253 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ly6eQ64253 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ly6eQ64253 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ly6eQ64253 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ly6eQ64253 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ly6eQ64253 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ly6eQ64253 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ly6eQ64253 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ly6eQ64253 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ly6eQ64253 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ly6eQ64253 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ly6eQ64253 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ly6eQ64253 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ly6eQ64253 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ly6eQ64253 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ly6eQ64253 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ly6eQ64253 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ly6eQ64253 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ly6eQ64253 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ly6eQ64253 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ly6eQ64253 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ly6eQ64253 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ly6eQ64253 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ly6eQ64253 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ly6eQ64253 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ly6eQ64253 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ly6eQ64253 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ly6eQ64253 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ly6eQ64253 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ly6eQ64253 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ly6eQ64253 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ly6eQ64253 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms