Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col4a5Q63ZW6 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col4a5Q63ZW6 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col4a5Q63ZW6 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col4a5Q63ZW6 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col4a5Q63ZW6 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col4a5Q63ZW6 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col4a5Q63ZW6 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col4a5Q63ZW6 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Col4a5Q63ZW6 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col4a5Q63ZW6 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col4a5Q63ZW6 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col4a5Q63ZW6 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col4a5Q63ZW6 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Col4a5Q63ZW6 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col4a5Q63ZW6 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col4a5Q63ZW6 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col4a5Q63ZW6 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col4a5Q63ZW6 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col4a5Q63ZW6 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col4a5Q63ZW6 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col4a5Q63ZW6 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col4a5Q63ZW6 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col4a5Q63ZW6 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col4a5Q63ZW6 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col4a5Q63ZW6 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col4a5Q63ZW6 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col4a5Q63ZW6 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col4a5Q63ZW6 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col4a5Q63ZW6 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col4a5Q63ZW6 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Col4a5Q63ZW6 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col4a5Q63ZW6 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Col4a5Q63ZW6 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Col4a5Q63ZW6 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Col4a5Q63ZW6 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col4a5Q63ZW6 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Col4a5Q63ZW6 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col4a5Q63ZW6 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col4a5Q63ZW6 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Col4a5Q63ZW6 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Col4a5Q63ZW6 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Col4a5Q63ZW6 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Col4a5Q63ZW6 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Col4a5Q63ZW6 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Col4a5Q63ZW6 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Col4a5Q63ZW6 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Col4a5Q63ZW6 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Col4a5Q63ZW6 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Col4a5Q63ZW6 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Col4a5Q63ZW6 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Col4a5Q63ZW6 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Col4a5Q63ZW6 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Col4a5Q63ZW6 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Col4a5Q63ZW6 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Col4a5Q63ZW6 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Col4a5Q63ZW6 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Col4a5Q63ZW6 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Col4a5Q63ZW6 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Col4a5Q63ZW6 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Col4a5Q63ZW6 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Col4a5Q63ZW6 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Col4a5Q63ZW6 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Col4a5Q63ZW6 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Col4a5Q63ZW6 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Col4a5Q63ZW6 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Col4a5Q63ZW6 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Col4a5Q63ZW6 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Col4a5Q63ZW6 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Col4a5Q63ZW6 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Col4a5Q63ZW6 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Col4a5Q63ZW6 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Col4a5Q63ZW6 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Col4a5Q63ZW6 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Col4a5Q63ZW6 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Col4a5Q63ZW6 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Col4a5Q63ZW6 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Col4a5Q63ZW6 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Col4a5Q63ZW6 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Col4a5Q63ZW6 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Col4a5Q63ZW6 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Col4a5Q63ZW6 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Col4a5Q63ZW6 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Col4a5Q63ZW6 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Col4a5Q63ZW6 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Col4a5Q63ZW6 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Col4a5Q63ZW6 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Col4a5Q63ZW6 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Col4a5Q63ZW6 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Col4a5Q63ZW6 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Col4a5Q63ZW6 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Col4a5Q63ZW6 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Col4a5Q63ZW6 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Col4a5Q63ZW6 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Col4a5Q63ZW6 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Col4a5Q63ZW6 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Col4a5Q63ZW6 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Col4a5Q63ZW6 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Col4a5Q63ZW6 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Col4a5Q63ZW6 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
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