Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms