Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
JrkQ60976 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
JrkQ60976 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
JrkQ60976 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
JrkQ60976 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
JrkQ60976 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
JrkQ60976 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
JrkQ60976 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
JrkQ60976 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
JrkQ60976 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
JrkQ60976 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
JrkQ60976 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
JrkQ60976 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
JrkQ60976 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
JrkQ60976 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
JrkQ60976 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
JrkQ60976 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
JrkQ60976 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
JrkQ60976 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
JrkQ60976 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
JrkQ60976 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
JrkQ60976 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
JrkQ60976 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
JrkQ60976 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
JrkQ60976 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
JrkQ60976 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
JrkQ60976 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
JrkQ60976 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
JrkQ60976 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
JrkQ60976 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
JrkQ60976 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
JrkQ60976 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
JrkQ60976 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
JrkQ60976 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
JrkQ60976 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
JrkQ60976 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
JrkQ60976 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
JrkQ60976 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
JrkQ60976 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
JrkQ60976 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
JrkQ60976 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
JrkQ60976 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
JrkQ60976 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
JrkQ60976 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
JrkQ60976 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
JrkQ60976 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
JrkQ60976 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
JrkQ60976 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
JrkQ60976 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
JrkQ60976 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
JrkQ60976 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
JrkQ60976 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
JrkQ60976 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
JrkQ60976 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
JrkQ60976 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
JrkQ60976 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
JrkQ60976 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
JrkQ60976 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
JrkQ60976 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
JrkQ60976 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
JrkQ60976 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
JrkQ60976 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
JrkQ60976 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
JrkQ60976 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
JrkQ60976 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
JrkQ60976 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
JrkQ60976 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
JrkQ60976 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
JrkQ60976 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
JrkQ60976 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
JrkQ60976 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
JrkQ60976 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
JrkQ60976 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
JrkQ60976 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
JrkQ60976 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
JrkQ60976 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
JrkQ60976 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
JrkQ60976 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
JrkQ60976 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
JrkQ60976 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
JrkQ60976 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
JrkQ60976 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
JrkQ60976 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
JrkQ60976 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
JrkQ60976 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
JrkQ60976 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
JrkQ60976 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
JrkQ60976 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
JrkQ60976 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
JrkQ60976 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
JrkQ60976 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
JrkQ60976 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
JrkQ60976 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
JrkQ60976 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
JrkQ60976 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
JrkQ60976 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
JrkQ60976 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
JrkQ60976 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
JrkQ60976 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
JrkQ60976 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms