Protein–RNA interactions for Protein: Q60737

Csnk2a1, Casein kinase II subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a1Q60737 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnk2a1Q60737 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnk2a1Q60737 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnk2a1Q60737 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnk2a1Q60737 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnk2a1Q60737 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnk2a1Q60737 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnk2a1Q60737 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnk2a1Q60737 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnk2a1Q60737 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnk2a1Q60737 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnk2a1Q60737 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnk2a1Q60737 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnk2a1Q60737 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnk2a1Q60737 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnk2a1Q60737 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnk2a1Q60737 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnk2a1Q60737 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnk2a1Q60737 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnk2a1Q60737 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnk2a1Q60737 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnk2a1Q60737 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnk2a1Q60737 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnk2a1Q60737 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnk2a1Q60737 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnk2a1Q60737 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnk2a1Q60737 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnk2a1Q60737 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnk2a1Q60737 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnk2a1Q60737 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnk2a1Q60737 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnk2a1Q60737 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnk2a1Q60737 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnk2a1Q60737 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnk2a1Q60737 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnk2a1Q60737 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnk2a1Q60737 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnk2a1Q60737 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnk2a1Q60737 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnk2a1Q60737 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnk2a1Q60737 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnk2a1Q60737 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnk2a1Q60737 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnk2a1Q60737 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnk2a1Q60737 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnk2a1Q60737 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnk2a1Q60737 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnk2a1Q60737 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnk2a1Q60737 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnk2a1Q60737 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnk2a1Q60737 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnk2a1Q60737 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnk2a1Q60737 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnk2a1Q60737 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnk2a1Q60737 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnk2a1Q60737 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnk2a1Q60737 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnk2a1Q60737 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnk2a1Q60737 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnk2a1Q60737 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnk2a1Q60737 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnk2a1Q60737 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnk2a1Q60737 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnk2a1Q60737 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnk2a1Q60737 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnk2a1Q60737 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnk2a1Q60737 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnk2a1Q60737 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnk2a1Q60737 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnk2a1Q60737 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnk2a1Q60737 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnk2a1Q60737 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnk2a1Q60737 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnk2a1Q60737 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnk2a1Q60737 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnk2a1Q60737 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnk2a1Q60737 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnk2a1Q60737 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnk2a1Q60737 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnk2a1Q60737 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnk2a1Q60737 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnk2a1Q60737 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnk2a1Q60737 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnk2a1Q60737 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnk2a1Q60737 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnk2a1Q60737 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnk2a1Q60737 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnk2a1Q60737 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnk2a1Q60737 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnk2a1Q60737 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnk2a1Q60737 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnk2a1Q60737 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnk2a1Q60737 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnk2a1Q60737 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnk2a1Q60737 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnk2a1Q60737 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnk2a1Q60737 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnk2a1Q60737 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnk2a1Q60737 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnk2a1Q60737 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms